四圣兽

这个坑很大，第一部没登场，第二部青龙出来了，实力和能力之强都让人怀疑第一部四天王是怎么把这四个BUG封印的，第三部大显身手自然不用多说了。四圣兽自身数码宝贝中本身被设定为各自镇守四方的神兽，是守护数码世界东西南北各个方位的四个究极体圣兽型数码兽，旗下十二神将是以十二生肖为原型的完全体数码兽，位于中心的还有最强的黄龙兽坐镇。不过要分清它们虽然是神，但很可惜是管理大陆的神，天上的事它们不管，数码世界似乎把海洋和陆地混成一起了。

三大天使

四圣兽+黄龙兽是管理大陆的，那天空的管理者自然就是光明兽了，旗下是三大天使，（注意这里的炽天使和座天使并不是阿武和嘉儿的那两只，野生数码兽可以进化到三大天使甚至是皇骑，但有没有和正牌相抗衡的实力还有资格都不好说）他们基本上是维持天空的和谐窥视着地面，四圣兽管不过来的时候他们也管管。

古代十斗士

光明兽堕落后引发了数码世界的灾难，而反抗统治的正是古代十斗士，这也成了第四部开始的基础，它们遗留下了10种不同属性的“斗士之魂”，十斗士本尊基本上是不会登场了，三大天使不能接受光明兽的堕落，但介意身份一方面不好意思出手，另一方面也没法阻止，所以只能找一堆孩子来收拾残局和擦屁股，所以座天使出头找到了继承十斗士精神的孩子来针对光明兽。所以实际上这个势力在现在的数码世界中是不存在的，想要登场只能让拓也来搞事。

七魔王

有自己纹章的反派组织，成员大家都知道，不过没有这组织的详细设定，也不知道这七个人是怎么凑到一起的，理论上类似于强大的魔王汇集在一起为了共同颠覆世界的目的而存在，不过每个人颠覆和掌控世界的方式和目的都不尽相同（很好奇他们七个怎么自己内部没打起来）和皇骑有着众多的冲突，不过基本上都是以失败收尾的。

皇家骑士团

皇骑的人员其实早就在第一、二部就有渗透了，不过成员是后续慢慢猜补完的，如今十三位皇骑成员敲定后也算是完整了。他们是数码世界主机世界树为了保持数码世界平衡清洗冗余数码兽而成立的组织，说白了就是杀毒软件，跟电脑里的360差不多了，该清理垃圾的时候就去清理。不过这十三个哥们不齐心就是了，各有各自的想法，指不定哪天不爽自己内部就互殴起来了，当然世界树如果不老实搞事的话他们也会考虑以下犯上，当然也仅限于个别有实力的皇骑。

世界树在第五部还有剧场版接连的搞事（漫画和游戏就不说了）所以总是被收拾，当最终BOSS和被卸载腻了的世界树选择了沉睡，所以选了名为“恒常性”的接班人代替自己管理世界，皇骑转而继续听从恒常性的命令，tri的剧情中皇骑的主人也恰恰就是恒常性，也是极有可能成为最终BOSS的存在。

也就是说皇骑是正牌的数码世界的神，就地位和实力上来说是比四圣兽+三天使还要高大上的存在，奈何这十三个哥们太有个性了，不咋干正事，不是沉睡就是跑到人类世界给人当萌宠隐名埋姓。所以当权人找了三天使+四圣兽这种会坐班的公务员来管理整个大世界。

帝皇龙甲的圣骑士模式算是皇骑的始祖，不位列与皇骑之中，估计应该是最初世界树手下没人的时候，初次搞事就让帝皇龙教做人了，所以世界树怕哪天自己又开始作死所以特别设立了骑士团来方便管理办事。

奥林匹斯十二神

管理着数码世界·伊利亚斯以古希腊神话奥林匹斯十二主神为原型的数码兽，伊利亚斯是与世界树统治的数码世界不同的，存在于其他服务器的数码世界。而这个数码世界主要就由奥林匹斯十二主神来管理，简单来说就是不同服务器的数码宝贝，这么一看感觉世界树也挺Low的，搞半天自己这么高的地位就管一个服务器。