深圳农村商业银行全称为深圳农村商业银行股份有限公司，这个名字原本就是简称，口头语简称一般说“农商”或“深农商”，当并非官方简称，在深圳周边城市也有类似的广州农村商业银行、东莞农村商业银行，所以不规范的简称容易引起混淆。

2004年，深圳农村信用社经中国银行业监督管理委员会和广东省人民政府批准从广东省农村信用社体系中单列出来，独立改制组建深圳农村商业银行。

深圳农村商业银行股份有限公司成立于2005年12月9日，是在原深圳市农村信用合作社联合社及其辖属18家农村信用社的基础上，吸收深圳本地社区企业、民营企业、原农村信用社社员和员工作为发起人，依法发起设立的股份制农村商业银行，也是继北京上海之后，我国第三家在副省级以上城市成立的地方性股份制农村商业银行。