北京小客车摇号申请流程是：

首先登录北京市小客车指标调控管理信息系统网站。

选择个人新购车辆填报，点击新购车辆填报下的个人新购车辆填报菜单，进入个人填报界面。

在申报填写界面认真仔细阅读各提示，如实填写相应信息，确认信息填写无误后点击下一步。

点击下一步进入信息确认页面，确认填写所有信息无误，然后点击下一步，弹出提示框点击确定后进入短信确认。