唐卡颜料传统上是全部采用金、银、珍珠、玛瑙、珊瑚、松石、孔雀石、朱砂等珍贵的矿物宝石和藏红花、大黄、蓝靛等植物为颜料以示其神圣。这些天然原料保证了所绘制的唐卡色泽鲜艳，璀璨夺目，虽经几百年的岁月，仍是色泽艳丽明亮。

矿物颜料常用的有：仁布白土（白）、朱砂（红）、青金石（石青）、孔雀石（石绿）、雄黄/雌黄（黄）、黄丹（橙）。植物颜料常用有花青色、胭脂色等，植物颜料的制作工艺相比于矿物颜料要简单。首先采集花木或树皮，清洗后浸泡或熬煮，得到不同颜色的汁水后，蒸发制成颜色丸即可 。