通常进化
数码兽进化过程中会经历各个世代（等级）。
蛋时期→幼年期I→幼年期II→成长期→成熟期→完全体→究极体
如：黑球兽→滚球兽→亚古兽→暴龙兽→机械暴龙兽→战斗暴龙兽
数码兽就像这样完成进化，不过他们的进化其实需要消耗很大能量。等级越高对应消耗的量级也越大。这些能量的基础就是数码兽从网络上吸收的数据。数据以食物形式从嘴巴摄入体内并积蓄。
与人类吃饭一样，通常情况下数码兽如果不积蓄能量就无法生存，进化也需要维持进化所需的最低限度的量，通常不得不积蓄一定量的能量。如果能量消耗殆尽身体就会衰弱「生病」，或「退化」成以前的形态，最坏的情况就是死亡。
此外，数码兽似乎还会从战败的数码兽身上获取数据的一部分，并将其作为能量。特别是必须大量摄取能量的成熟期之后的数码兽，打倒敌人获取其数据或是为了生存、为了进化而采取的最为重要的行为之一。
特殊进化
除了通常进化外，还有例外的各种特殊进化方法和进化形态存在。统称为特殊进化。
以下为特殊进化：
联展进化
「Jogress（联展）」是由Joint（联合）及Progress（进步、发展）构成的合成词，又称「合步」。最初设定上数码兽之间合体，向上进化一个等级的技术称为「合步」，而等级没有变化则称为「合体」。
成熟期以上的数码兽，可以以成熟期＋成熟期、成熟期＋完全体、完全体＋完全体、究极体＋究极体等形式完成联展。不是任何数码兽都能进行联展，数码兽之间还存在相性等因素。其中究极体之间的联展，更是仅限屈指可数的数码兽使用。战斗暴龙兽＋金属加鲁鲁兽＝奥米加兽就是具有代表性的例子。
而最近三体以上数码兽同时联展的技术也出现了。另外，联展后的数码兽不以「联展体」等称呼，以普通的等级名称呼。不过仅限究极体，有时也被称为「合体究极体」。
如：番长狮子兽+暗龙兽+瓦尔德兽+斯雷普兽→究极混沌兽
装甲进化
数码世界创世之初，在被称为「古代数码世界时期」繁荣的「古代种」数码兽才能使用的进化成为装甲进化。
古代种数码兽使用名为「数码精神」的蕴藏着进化能量的道具进化。力量方面相当于成熟期水平，但根据进化前数码兽的资质和与数码精神的相性，有时也具有相当于完全体甚至究极体的力量，如玛格纳兽。相反地如果相性不合，有时也会进化成力量失控的凶暴数码兽。装甲进化后的数码兽被称为「装甲体」。
黑暗进化
愤怒、憎恨、悲伤等「负能量」对数码兽的「数码核」产生影响，会让他们进化成邪恶的存在。垂耳兔兽→温迪兽、数码蛋兽→恶魔蛋兽就是代表性的例子。不过，邪恶的进化并不意味着是「错误的进化」。除此之外，「数码兽的感情」会影响进化的例子也屡见不鲜。
《数码兽大冒险》暴龙兽→ 丧尸暴龙兽
《数码兽驯兽师》大古拉兽→破灭魔龙兽
《数码兽大冒险：》机械暴龙兽→无限龙兽
魂进化
「斗士之魂」据说是「古代数码世界时期」曾经拯救世界的「十斗士」数码兽预测到未来可能引发的危机，并将自己的能力封印起来分散到世界各地而流传下来的道具。而解放「斗士之魂」并进化的数码兽被称为「混合体」。
看上似乎与「数码精神」有点相似，不过存在着很大的不同之处。这就在于能否「将模拟信号的人类所拥有的可能性变换乘算成数字生命体」。变换乘算——也就是将人类分解为数字数据矩阵，与数码兽融合。不过，并非只与人类融合才发挥效力，即使将数码兽作为媒介也会发挥「斗士之魂」的效果。
此外，兽型斗士之魂与人型斗士之魂互相调和，通过融合触发双魂进化、超魂进化、远古魂进化等，还能向更高阶段进化。
恺撒暴龙兽和玛格纳加鲁鲁兽是由兽型斗士之魂与人型斗士之魂而诞生的混合体的进一步进化姿态，被称为「超越形态」或「超越种」，据说他们拥有超越普通究极体甚至十斗士的力量。
特殊变异
在数码兽中存在十分罕见的向同等级数码兽进化的情况（成熟期向成熟期进化等）。这是仅在满足特殊条件的情况下发生的现象，详情不明。该名称也非正式，可能与数码兽的类型之一「突然变异型」数码兽有关。
X-进化
具有高度导出「数码核」内信息能力的「X抗体」成为完成体时发生的进化称为「X-进化」。能够最大限度激发出数码兽所拥有的潜在能力，发挥出超越原来形态的力量。
死之X-进化
死之X-进化是实施于原型数码兽第一实验体「多路系列」的即使死亡也要通过摄取其他数码兽数码核进行反复进化的，持续生存的改造。发生于受「X抗体」的影响其沉睡的信息被导出。
突风进化
突风进化是指短时间的一种临时进化，进行突风进化的究极体可以变形为更加强大的究极体形态。
阿尔法兽→阿尔法兽：王龙剑
爆裂进化
爆裂进化是一种类似突风进化和形态转换的进化模式。一只究极体数码兽被冲入极大质量的数码之魂后，就可进化成更有力量的自身变种，身体旁经常包裹有能量环。当处于这种形态下，数码兽可能会耗光出他们所有的力量退化回数码蛋。
闪光暴龙兽 → 闪光暴龙兽爆裂形态
幻影加奥加兽 → 幻影加奥加兽爆裂形态
蔷薇兽 → 蔷薇兽爆裂形态
渡鸦兽 → 渡鸦兽爆裂形态
生化进化
混合生化进化是种人类将数码兽的数据灌输进自身DNA从而进化成各自形态的完全体数码兽的进化过程。还存在进化成究极体的进阶版本混合生化高阶进化。
拟似进化
拟似进化（擬似進化）是种用人工的数码之魂或者其他媒介来进化成数码兽的进化方式。
基兹兽AT→基兹兽XT
数码合体
数码合体是一种和进化有关的过程，是将多个的数码兽融合成一个单体的联合实体，通常被某只部件数码兽所掌控行动。